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上海交通大学医学院附属新华医院创建于1958年，是新中国诞生后在上海兴建的首家综合性教学医院。
儿科、心血管内科、骨科为国家级重点学科。设有卫生部遗传医学新生儿筛查及遗传代谢病中心等6个诊治中心，小儿心血管病和小儿外科畸形两个市级临床医学中心；设有上海市儿科医学研究所、上海市小儿先天性心脏病研究所和上海市环境与儿童健康重点实验室三所市级研究机构。
医院拥有三所市级研究机构：上海市儿科医学研究所、上海市小儿先天性心脏病研究所和上海市环境与儿童健康重点实验室；拥有上海市小儿外科畸形矫治临床医学中心；拥有儿科医学院、新华临床医学院和儿科继续教育学院三个上海交通大学医学院分支医学院；拥有上海交通大学医学院临床医学系、儿科学系、耳鼻咽喉学系、医学营养系四个医学教育系。投资设立新华医疗开发公司、新华泛亚医疗投资管理有限公司等实业机构。近年来，医院作为核心医院与上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心、上海交通大学医学院附属第三人民医院、崇明堡镇人民医院共同组建了新华医院集团，吸纳杨浦区中心医院为分院，并与本市及外地的市区县签约支援16所社区卫生服务中心和郊区、农村的医疗机构。
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