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        有8个研究所和3个支撑单元，分别是生物化学与细胞生物学研究所、神经科学研究所、药物研究所、植物生理生态研究所、健康科学研究所、营养科学研究所、上海巴斯德研究所和中科院-马普计算生物学伙伴研究所，以及上海生命科学信息中心、上海中科伍佰豪生物工程研究发展有限公司、上海实验动物中心。自2000年以来在国际顶级杂志Nature系列、Cell系列和Science发表论文87篇。其在理论和技术方面的优势将对上海市生物样本库的发展、疾病的新药研究和靶点治疗方面作出强有力的推动作用。

        上海生科院的重点研究领域主要有：功能基因组、蛋白质组和生物信息学，生物大分子的结构、相互作用及功能，细胞活动的分子网络调控，脑发育与脑功能的分子与细胞机制研究，防治重要疾病的新药研究开发、中药现代化研究以及药物研究的理论和方法，植物分子生理和植物与环境的相互作用，生物技术的创新和应用，生物医学转化型研究，现代营养科学研究，病毒学与免疫学研究，计算生物学研究，以及生命科学与其他学科的交叉研究。上海生科院根据国家重大战略需求和世界科技发展前沿，围绕建设以人口健康与医药为主线的生命科学创新基地的战略目标，将科技创新活动聚焦于生命现象本质的前沿探索和基础研究，人口健康重大问题的转化型研究，生物资源、农业和环境的关键问题等三大方向，努力在蛋白质科学和表观遗传调控研究、信号转导和细胞活动分子网络研究、脑与认知、神经系统疾病、创新药物、干细胞、肿瘤、糖尿病机理、营养与代谢、传染性疾病、生物能源、转基因作物等研究中作出重大原始创新的工作。